Институти су oсновне научноистраживачке организационе јединице на Факултету, у којима се научноистраживачка и високостручна делатност одвија кроз израду научноистраживачких пројеката, студија, експертиза, теренских и лабораторијских испитивања и израду и ревизију техничке документације у области грађевинарства и геодезије. Поред обављања креативних и специфичних научноистраживачких и високо стручних послова од заједничког интереса Факултета као целине, институти могу бити укључени и у пружање комерцијалних услуга у оквиру делатности Факултета.
Научноистраживачка и високостручна делатност института обавља се кроз:
• израду научноистраживачких пројеката и тема, које финансира надлежно
Министарство, односно друга заинтересована институција
• израду и ревизију инвестиционо техничке документације
• израду студија, експертиза и лабораторијских и теренских испитивања из области
грађевинарства и геодезије
У оквиру Института за хидротехнику и водно-еколошко инжењерство, под покровитељством UNESCO-a делује Међународни центар за воде у градским срединама IRTCUD/CUW (International Research and Training Centre on Urban Drainage/Centre for Urban Water).