Stručni opus prof. Jovanovića obuhvata numeričku simulaciju otvorenih tokova, zaštitu od poplava, analizu stabilnosti rečnog korita, hidrauličke posledice rušenja brana, hidrauliku objekata i dr. Bavi se analizom režima voda naših vodotoka (Dunav, Sava, Tisa, Tamiš, V. Morava, Nišava, Drina), uređenjem malih vodotoka na principima zaštite životne sredine i održivog razvoja, kao i projektovanjem plovne infrastrukture (regulacioni zahvati, hidraulika brodskih prevodnica, otpori u plovnim kanalima). Učestvovao je u izradi vodoprivredne osnove Srbije i Crne Gore i bio je koautor studija za potrebe Svetske banke (Studije poplava na području Srbije i Crne gore i Studije prioritetnih ulaganja u plovnu saobraćajnu infrastrukturu). Učestvovao u velikom broju ekspertiza i revizija projekata. Bio je angažovan na projektu čišćenja dunavskog korita od ostataka mostovskih konstrukcija u Novom Sadu, kao ekspert po pitanju rehabilitacije rečnog korita.

• Jovanović, M., Hidraulička analiza proboja brane jalovišta Grot i definisanje ugroženog područja, Tehnički rudarski projekat nadvišenja brane flotacijskog jalovišta rudnika Grot (Kriva Feja), Knjiga VIII, Sveska VIII.1, ITNMS, Gea d.o.o., Beograd, 2020.
• Jovanović, M. i dr., Hidrauličke posledice proloma brane jalovišta Valja Fundata, Gradjevinski fakultet, Beograd, 2019.
• Jovanović, M. i dr., Glavni projekti regulacije vodotoka u donjem toku Vrbasa, Flood Risk Management for Republika Srpska Emergency Flood Relief and Prevention - A (EIB No: 2010-0479), TG 23 - Preparation of Detail Designs for Flood Protection Measures at the North of the Republika Srpska, IWA Consult, Beograd, 2019.
• Jovanović, M., Dopunski rudarski projekat nadvišenja jalovišta i brane br. 9 rudnika i flotacije "Rudnik", Knjiga VII - Hidrauličke posledice proboja brane i tehnički projekat sistema za obeležavanje ugroženog područja, Gea d.o.o., Beograd, 2018.
• Jovanović, M. i dr., Druga faza izmeštanja i regulacije korita reke Kolubare sa pritokom Peštanom - dokumentacija o probnom radu, Institut "Jaroslav Černi", revizija Gradjevinski fakultet, Beograd, 2018.
• Jovanović, M., Ivetić, M., Rosić, N., Tehnička dokumentacija obaloutvrde reke Dunav i reke Save na širem području ušća Save u Dunav, Hidrauličke analize, Hidrozavod DTD i Gradjevinski fakultet-Beograd, Novi Sad, 2017.
• Jovanović, M., Kapor R., Elaborat o hidrauličkim posledicama rušenja brana jalovišta "Lece" kod Medvedje, Gradjevinski fakultet, Beograd, 2017.
• Jovanović, M., Snimanje i praćenje obaloutvrda i poprečne gradjevine na Moravi kod Markovačkog mosta - Elaborat o obavljenim aktivnostima sa predlogom regulacionih radova, Gradjevinski fakultet, Beograd, 2016.
• Jovanović, M., Projekat obaloutvrde na reci Savi kod Hrtkovca, konsultantske usluge, Hidrozavod DTD, Novi Sad, 2016.
• Jovanović, M. i dr., Tehnička kontrola Dopunskog rudarskog projekta proširenja flotacijskog jalovišta "Veliki Krivelj" na nulto polje, Gradjevinski fakultet, Beograd, 2016.
• Jovanović, M., Generalni projekat unapredjenja zaštite Sremske i Mačvanske Mitrovice od velikih voda Save, konsultantske usluge, Hidrozavod DTD, Novi Sad, 2016.
• Jovanović, M., Hidraulički proračuni ravanskog (2D) strujanja reke Save u zoni Mišarske Ade, Institut "Jaroslav Černi", Beograd, 2015.
• Jovanović, M. i dr., Tehnička kontrola Glavnog projekta uredjenja obala u zoni Mosta na Adi na ulazu u Čukarički zaliv, Gradjevinski fakultet, Beograd, 2012.
• Jovanović, M., Rosić, N., Hidraulička studija plavljenja dolina Božičke reke i reke Dragovištice, Gea d.o.o., Beograd, 2012.
• Jovanović, M., Prodanović, D., Plavšić, J., Rosić, N., Studija i Plan zaštite od poplava teritorije jedinice lokalne samouprave grada Čačka, Ehting i Građevinski fakultet, Beograd, 2012.
• Jovanović, M., Kapor, R., Prodanović, D., Zindović, B., Studija hidrotehničkog uređenja ulaza u Čukarički zaliv u uslovima nastalim izgradnjom novog mosta na reci Savi, Građevinski fakultet, Beograd, 2011.
• Jovanović, M., Kapor, R., Zindović, B., Projekat obaveštavanja i uzbunjivanja stanovništva na području ugroženom od rušenja brane flotacijskog jalovišta "H" u Boru - Opšti deo sa hidrauličkim proračunima, Građevinski fakultet, Beograd, 2010.
• Jovanović, M., Popovska, C., Poboljšanje hidrološkog režima reke Vardar kroz Skoplje, Knjiga VI-Hidraulička analiza postojećeg stanja, revizija, Gradjevinski fakulet-Skoplje, 2010.
• Jovanović, M., i dr., Projekat hitnih intervencija u koritu Velike Morave nizvodno od Markovačkog mosta radi poboljšanja snabdevanja vodom TE "Morava" i Idejni projekat, Građevinski fakultet i Institut za vodoprivredu "Jaroslav Černi", Beograd, 2007.
• Jovanović, M., Kapor, R., Prodanović, D., Đorđević, D., Zindović, B., Hidraulička studija funkcionisanja vodozahvata "Makiš", Građevinski fakultet, Beograd, 2007.
• Jovanović, M., Kapor, R., D., Zindović, B., Elaborat o obaveštavanju i uzbunjivanju stanovništva na području ugroženom od rušenja brana 1, 2 i 3 flotacijskog jalovišta "Veliki Krivelj" - Opšti deo sa hidrauličkim proračunom, Građevinski fakultet - Beograd, 2007.
• Jovanović, M., Kapor, R., Prodanović, D., Đorđević, D., Zindović, B., Elaborat o obaveštavanju i uzbunjivanju stanovništva na području ugroženom od rušenja brane "Rudnik" - Opšti deo sa hidrauličkim proračunom, Građevinski fakultet - Beograd, 2007. i 2014.
• Jovanović, M., Kapor, R., Prodanović, D., Đorđević, D., Hidrauličko-morfološka studija Dunava na ušću Save, Građevinski fakultet - Beograd, 2006.
• Jovanović, M., Kapor, R., Komatina, D., Đorđević, D., Babić Mladenović, M., Hidrauličko-morfološka studija reke Dunav za potrebe uređenja sektora Apatin, Građevinski fakultet - Beograd i Institut za vodoprivredu "Jaroslav Černi" - Beograd, 2006.
• Jovanović, M., Kapor, R., Prodanović, D., Zindović, B., Studija uticaja ispuštanja materijala izbagerovanog iz Čukaričkog zaliva u korito reke Save, Građevinski fakultet - Beograd, 2006.
• Jovanović, M., Kapor, R., Prodanović, D., Đorđević, D., Zindović, B., Sudija mosta na donjem špicu Ade Ciganlije na strujno polje i morfologiju korita reke Save na ulazu u Čukarički zaliv u Beogradu, Građevinski fakultet - Beograd, 2006.
• Jovanović, M., Plan odbrane od bujičnih poplava i plan za proglašenje erozionih područja na široj teritoriji grada Beograda (rukovođenje revidentskog tima), Građevinski fakultet - Beograd, 2005.
• Jovanović, M., Kapor, R., Prodanović, D., Zindović, B., Hidraulička studija Čukaričkog zaliva i njegovog spoja sa rekom Savom, Građevinski fakultet - Beograd, 2005.
• Jovanović, M., Kapor, R., Komatina, D., Đorđević, D., Stefanović, N., Idejni projekat sistema osmatranja i obaveštavanja na području ugroženom od rušenja nasipa na pepelištu "Kostolac", Građevinski fakultet - Beograd, 2003.
• Jovanović, M., Projekat sistema osmatranja i obaveštavanja na području ugorženom od rušenja brane Selište na Goču - opšti deo sa hidraulickim proracunima, Građevinski fakultet-Beograd, 1995.
• Jovanović, M., Varga, S., Studija o mogućnostima formiranja retencija u priobalju Tise, Institut za vodoprivredu "Jaroslav Černi", Beograd, 1992.
• Jovanović, M., Analiza propagacije poplavnih talasa u donjem toku Drine pri i posle izgradnje hidroelektrana Kozluk, Drina 1, Drina 2 i Drina 3, studija, Energoprojekt, Beograd, 1991.
• Jovanović, M., Rešenje problema zaštite Pirota od velikih voda reke Nišave u uslovima rada HE Zavoj, studija, 1991.
• Jovanović, M., Jovanović, B., Varijantna rešenja energetsko-plovidbenog sistema "Morava" - deonica od Dunava do Niša, studija, 1990.
• Jovanović, M., Muškatirović, D., Hidrauličke studije nastanka i propagacije poplavnih talasa u slučaju proloma brana na Železničkoj reci (1989), "Vukosić" na reci Dobravi (1989), "Duboki potok" (1990), "Kračevica" (1990) i brana na jalovištima "Rudnica" (1988) i "Dečkin potok" (1989), Građevinski fakultet, Beograd.
• Muškatirović, D., Maletin, M., Jovanović, M., Veljković, M., Investiciono tehnička dokumentacija kanala i luke Smederevo - Idejni projekat saobraćajno-tehnološkog precesa, Građevinski fakultet, Beograd, 1985.
• Muškatirović, D., Stevanović, S., Jovanović, M., Lazović, M., Idejno rešenje izgradnje pristanišnih, železničkih i skladišnih kapaciteta za potrebe Metalurskog kombinata u Smederevu, Građevinski fakultet, Beograd, 1985.
• Jovanović, M., Radojković, M., Ravanski matematički model za prognozu hidrauličkih posledica rušenja brana u sistemu HE Perućica, Građevinski fakultet, Beograd, 1984.
• Jovanović, M., Analiza hidrauličkih posledica isključenja inundacije na desnoj obali Dunava nizvodno od Smederevske ade, km 1110+865 do km 1111+865, studija, Građevinski fakultet, Beograd, 1984.
• Jovanović, M., Hidraulička analiza strujanja vode i kretanja vučenog nanosa u neregulisanom i regulisanom koritu reke Toplice na potezu od km 8+130 do km 31+570, studija, Građevinski fakultet, Beograd, 1982.
• Jovanović, M., Muškatirović, D., Hidraulička studija Dunava u zoni mosta "25. Maj", km 1297+064, Građevinski fakultet, Beograd, 1980.
• Muškatirović, M., Jovanović, M., Nikolić, D., Idejno rešenje pristaništa za tečne terete u Novom Sadu, Građevinski fakultet, Beograd, 1979.
• Muškatirović, D., Jovanović, M., Jovin, B., Hidraulička studija uz idejno rešenje rekreacionog centra na ostrvu Suraidat na reci Tigar u Bagdadu, 1979.